小小藍色菌摘得國際遺傳工程機器大賽金獎

2016年11月21日11:15  來源:健康報網(wǎng)
 
原標(biāo)題:這株藍色菌得了國際大獎

近日,國際遺傳工程機器大賽在美國波士頓拉開帷幕。這場合成生物學(xué)領(lǐng)域的頂級國際賽事,吸引了全球五大洲30多個國家和地區(qū)的283支隊伍參賽。經(jīng)過5天的比賽,一株小小的藍色乳酸乳球菌摘得大賽金獎。這個通用工程菌株由第三軍醫(yī)大學(xué)21名本科生組成的研發(fā)團隊加工而成。評審專家表示,這是一種有望加快合成生物學(xué)研發(fā)效率的優(yōu)秀底盤生物。

瞄準更安全的底盤生物

合成生物學(xué)是綜合利用化學(xué)、物理、分子生物學(xué)、信息學(xué)的知識和技術(shù),設(shè)計、改造或重建生物分子、生物體部件、生物反應(yīng)系統(tǒng)、代謝途徑和過程,乃至細胞和生物個體的生物科學(xué)分支。簡而言之,就是“可以像組裝機器一樣組配生物”。

作為一門新興的交叉學(xué)科,合成生物學(xué)與人工智能、量子科技等并列為21世紀的顛覆性技術(shù),在疫苗生產(chǎn)、藥物研發(fā)、可再生能源生產(chǎn)、環(huán)境污染生物治理、以生物學(xué)為基礎(chǔ)的工業(yè)制造等多個領(lǐng)域具有極好的應(yīng)用前景。

“底盤生物是合成生物學(xué)中的重要元素之一!钡谌娽t(yī)大學(xué)參賽代表隊總負責(zé)人、第三軍醫(yī)大學(xué)基礎(chǔ)部微生物學(xué)教研室主任饒賢才介紹,“我們把一種活的生命體或細胞命名為底盤生物,將其他生物工程系統(tǒng)植入到底盤生物上,研發(fā)出新性能生物。打個比方,底盤生物就像汽車的車架,根據(jù)車架可以安裝不同系統(tǒng)和零部件,制造不同品牌的汽車!

常用的底盤生物包括大腸桿菌、枯草芽胞桿菌、酵母菌等。而細菌中使用最廣泛的底盤生物大腸桿菌,在藥物載體、疫苗研發(fā)等方面均存在一定的安全局限性!盀閷ふ腋踩牡妆P生物,我們將目光投向了乳酸菌。”參賽隊指導(dǎo)老師、第三軍醫(yī)大學(xué)微生物學(xué)教研室胡啟文副教授介紹,乳酸乳球菌是基礎(chǔ)研究領(lǐng)域非常有積累的一種工程菌,長期應(yīng)用在奶酪和黃油的發(fā)酵生產(chǎn)中。近年來,多國科學(xué)家嘗試利用乳酸乳球菌作為新型藥物、疫苗的載體;蚪M測序結(jié)果分析表明,乳酸乳球菌基因組中不含編碼毒素等損害人類健康的基因。美國食藥監(jiān)局已將其設(shè)定為安全共識微生物。重組表達白介素-10的基因工程乳酸乳球菌是第一個被美國食藥監(jiān)局批準用于臨床試驗的細菌,而且Ⅰ期臨床試驗結(jié)果再次證明了乳酸乳球菌的安全性。

從“萬里挑一”到“所見即所得”

從2016年3月開始,第三軍醫(yī)大學(xué)參賽隊員對乳酸乳球菌進行了巧妙的基因工程設(shè)計和改造,經(jīng)過長達8個月的集體攻關(guān),最終“加工”出一株藍色的通用工程菌和一套基因工程工具包,為科研提供了一種高效的基因組快速整合篩選系統(tǒng)。

“過去在底盤生物上植入其他基因工程零部件或系統(tǒng),由于生物學(xué)客觀規(guī)律的限制,是否成功要一個一個檢驗。一般情況下,在一萬個菌株中,只有幾個或十幾個能成功,真可謂萬里挑一!钡谌娽t(yī)大學(xué)參賽隊隊長黃志剛興奮地說,“而我們加工出的乳酸乳球菌,在適當(dāng)培養(yǎng)基上呈藍色,使用工具包植入其他有用的基因工程零部件或系統(tǒng)后,如果成功則會顯示為白色。這種差別一目了然,高效且無任何抗生素耐藥基因殘留!

“這是合成生物學(xué)領(lǐng)域重要的基礎(chǔ)性改進,大量生物工程零部件及系統(tǒng)今后有望加載到乳酸乳球菌上,尤其在藥物載體、疫苗遞送等方面具有極大應(yīng)有前景。同時,我們的成功經(jīng)驗也為其他底盤生物的優(yōu)化提供了借鑒思路!眳①愱狀I(lǐng)隊、第三軍醫(yī)大學(xué)微生物學(xué)教研室副主任胡曉梅教授說,目前,對底盤生物的改造主要有兩種策略:一是使其加載更多的“東西”,另一種是植入某些元素讓其運行更加高效。該研究的成功,豐富了第二種思路的實現(xiàn)路徑。

期待美味與健康兼得

參賽隊指導(dǎo)老師王競博士告訴記者,隊員們還對優(yōu)化的乳酸乳球菌引入了食品級篩選標(biāo)記抗性基因,增加了乳酸乳球菌對食品級篩選劑抗菌肽的耐受性,能夠進一步增加具有生物治療等功能的蛋白、多肽及多糖等的產(chǎn)量。同時,通過引導(dǎo)肽、錨定蛋白等融合設(shè)計,優(yōu)化這些治療性蛋白及多肽的空間定位,將乳酸乳球菌進一步升級。

“最近,我們在升級版的乳酸乳球菌上加載了臨床上治療骨質(zhì)疏松的多肽藥物降鈣素,在另一個設(shè)計中,我們加載了一種腸道致病菌傷寒沙門菌的Vi抗原,已經(jīng)成功得到這兩種‘強強聯(lián)合’的基因工程菌株!秉S志剛說,下一步,團隊將利用動物模型,通過直接給實驗動物飼喂基因工程菌株或其發(fā)酵產(chǎn)物如奶酪、黃油、酸奶等,檢驗它們在治療骨質(zhì)疏松、預(yù)防傷寒沙門菌感染中是否能達到預(yù)期效果。

“我們期待,未來可以通過喝下一杯基因工程酸奶,或吃下一塊基因工程奶酪,就能達到治療慢性疾病、預(yù)防傳染病等目的,讓美味與健康兼得!焙鷨⑽你裤降馈#ㄓ浾 王瀟雨 王 丹 通訊員 李燕燕)

來源:《健康報》

(責(zé)編:孫奕菲、姚欣雨)

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